Ido Tamir
2017-06-07 13:24:32 UTC
miRBase 21已於2014年6月26日發布，目前仍處於發展階段。為什麼不再更新或宣布項目正式死亡？ ENSEMBL還使用miRBase作為起點（ http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/ncrna.html）。
人們現在使用的是什麼是對miRNA的良好參考，尤其是對於註釋不充分/排序較差的物種？
嗨Ido Tamir，歡迎來到生物信息學堆棧交換，謝謝您的提問。 Stack Exchange社區試圖鼓勵提出可以確定，客觀答案的特定問題。如果您可以通過添加更多關於為什麼提出問題的上下文/故事，或者通過減少問題的開放性來修改您的問題以適合這種格式，將不勝感激。生物信息學是一個非常大的學科領域，並且經常有許多不同的方法來做同一件事。
在請求最新的miRNA數據庫時，哪一部分不確定？您的意思是我應該指定最後一次更新應該是在2016年6月5日？
對我的快速互聯網搜索在首頁中至少返回了4個不同的數據庫：[1-miRBase]（http://www.mirbase.org/）； [2]（http://mirdb.org/）； [3]（http://www.microrna.org/microrna/home.do）； [4]（http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/）。這是在生物信息學中非常普遍的現象，在該領域中創建了多種解決方案來解決非常相似的問題。所使用的特定數據庫將取決於您的特定應用程序，因為每個數據庫都有自己的優點和缺點（例如，敏感性和特異性之間的權衡）。