題:
什麼是“可能的聚合酶連續片段”?
l0110
2018-06-10 06:23:30 UTC
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我最近使用 gffcompare比較了新組裝的轉錄組和已發表的轉錄組。類代碼“ p”的成績單是“可能在上面運行的聚合酶”。

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這是什麼意思?我非常努力,但仍然找不到答案。

二 答案:
Ian Sudbery
2018-06-11 15:22:47 UTC
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在大多數編碼基因上(複製依賴性組蛋白基因除外),轉錄物(與轉錄 tion 相對)通過裂解的聚腺苷酸化位點終止,轉錄物被蛋白質複合物和poly-A尾部切割。但是,PolII繼續轉錄,直到被魚雷終止為止(請參見此處)。通常,polyA位點後的多餘RNA被Xrn2降解,但是如果您在任何時候捕獲細胞中任何特定的RNA快照,都會有少量與轉錄有關。

謝謝您的幫助,伊恩!您提到的情況似乎只能發生在基因的下游。那是對的嗎?
是的,這只應發生在基因的下游。
Devon Ryan
2018-06-11 11:59:32 UTC
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連續片段背後的一般想法是背景噪音。這源自基因組的一個開放區域,該區域緊鄰實際轉錄的區域。因此,所有轉錄機制都已經存在,因此,如果該區域採用了更多的開放構象,則該機制可能會偶發地結合併開始轉錄。您可以獲取那些上游或下游基因。許多這樣的事情只是背景轉錄噪音。

謝謝,德文郡!是否有與該主題相關的論文,例如,評論或研究論文,我可以閱讀更多(並在將來引用)?
我不知道,儘管@IanSudbery可能知道一個。


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