user1309
2017-08-10 21:25:38 UTC
我有一些正在處理的數據，我很好奇我是否能夠使用費舍爾方法將來自配對t檢驗的基因組中CpG位點的p值組合起來，從而為每個獨特基因獲得一個p值。鏈接此處是Fisher方法的Wikipedia頁面。我了解所用方法的一個假設是，要組合的每個單獨的p值必須是獨立的。我是生物統計學的新手，所以我很好奇是否使用來自同一基因的CpG是否會違反這一假設。
為什麼要融合CpG值？您是否想知道特定基因/區域是否比其他基因/區域磷酸化程度更高？您的假設是什麼（您對CpG位點進行了t檢驗？您是否在測試它們是否被磷酸化，而不是或不高於其他基因組，或者...？
簡而言之，您的直覺是正確的：它們不是獨立的。