題:
DEseq2中的計數單位是什麼?
julianstanley
2018-01-27 03:53:09 UTC
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我想這是一個非常愚蠢/簡單的問題。

DESeq2計數什麼單位?還是單位是任意的,但內部讀取的實際讀數是一致的?

一 回答:
Devon Ryan
2018-01-27 04:00:05 UTC
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對於單端數據集,計數是“讀取”,對於雙端數據集,計數是“碎片”。換句話說,它們就是featureCounts和htseq-count產生的。恰當地命名,您將能夠在DESeq2中訪問的“歸一化計數”只是簡單的歸一化版本,以使各個樣本之間的值具有可比性。



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