medbe
2017-06-04 04:01:34 UTC
爆炸報告E值，但短讀映射器報告映射質量。它們是一樣的嗎？它們可以互相轉換嗎？如果不是，為什麼blast不能報告映射質量，而短讀映射器卻不能報告E值？
爆炸報告E值，但短讀映射器報告映射質量。它們是一樣的嗎？它們可以互相轉換嗎？如果不是，為什麼blast不能報告映射質量，而短讀映射器卻不能報告E值？
E值和映射質量是兩個非常不同的事物。
E值是“一個參數，它描述了搜索“特定大小的數據庫”。可以在這裡找到更多詳細信息： https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastDocs&DOC_TYPE=FAQ#expect
映射質量是一種嘗試，以估計來自給定讀數的給定鹼基正確映射到參考基因組中特定位置的可能性。不同的定位器計算映射質量的方式非常不同，因此沒有簡單的方法可以在定位器之間進行比較。但總體而言，映射質量將考慮以下內容：（i）基本調用的質量； （ii）參考文獻的重複結構； （iii）對齊算法； （iv）讀物是否具有映射對； （v）製圖軟件作者認為可能有幫助的其他任何措施。
因此，E值和映射質量用於測量兩種用途完全不同的根本不同的屬性。