juniper-
2018-11-27 00:23:51 UTC
BWA mem具有跳過伴侶救援和跳過配對的 -S
和 -P
標籤;配合救援,除非也使用-S 。
這些是做什麼的?我假設 -P
彼此獨立地對齊讀取對。那是對的嗎?
-S
的作用是什麼?
您正在使用什麼版本的BWA內存?您是否看過隨bwa一起安裝的手冊? “請'man ./bwa.1'來獲得手冊。”
0.7.17;我確實看過手冊頁,但解釋有些含糊:_“-P:在成對配對模式下,執行SW僅可挽救丟失的匹配,但不要嘗試尋找合適的匹配。” _